Sé que podría implementar un root mean squared error de función como esta:

def rmse(predictions, targets):
    return np.sqrt(((predictions - targets) ** 2).mean())

Lo que estoy buscando, si este rmse función es implementada en una biblioteca en algún lugar, quizás en scipy o scikit-learn?

  • usted escribió la función de la derecha allí. Más probable es que si la función es simple escribir, no va a ser en una biblioteca. es mejor que la creación de un director llamado módulos y sólo la colocación de útiles funciones en ella y ponerla en la ruta
  • No estoy de acuerdo. Me gustaría encontrar una mucho más tranquilizador para llamar a una función de biblioteca que reimplementar a mí mismo. Por ejemplo, escribí .sum() en lugar de .mean() primera por error. Además, supongo que esta función es usada tanto que no veo ninguna razón por la que no debería estar disponible como una función de la librería.
  • Entiendo que el 100%, yo estaba especulando en la razón por la que este tipo de función puede no estar en scipy. Si es que no puedo encontrarla
  • Para la gente que esta probado y no funciona: si predictions y targets son, por ejemplo, de tipo int16 la plaza se desborden (dando números negativos). Así que usted puede ser que necesite un .astype('int') o .astype('double') antes de usar la plaza, como np.sqrt(((predictions - targets).astype('double') ** 2).mean()).
  • Otra ventaja de tener esto en sklearn es el sklearn implementaciones tienen un montón de adicional de la caldera de la placa de código para asegurarse de que las matrices son de la misma forma, e incluye los pesos de los parámetros y también se encarga de matrices multidimensionales y diferentes «matriz gusta». Haciendo todo lo que convierte a este en una mucho más complejo problema
InformationsquelleAutor siamii | 2013-06-19

8 Comentarios

  1. 172

    sklearn.metrics tiene un mean_squared_error función. El RMSE es simplemente la raíz cuadrada de lo que devuelve.

    from sklearn.metrics import mean_squared_error
    from math import sqrt
    
    rms = sqrt(mean_squared_error(y_actual, y_predicted))
  2. 105

    Lo que es RMSE? También conocido como el MSE, RMD, o RMS. ¿Qué problema resuelve?

    Si usted entiende RMSE: (Root mean squared error), MSE: (Error cuadrático medio) RMD (la media de la Raíz cuadrada de la desviación) y RMS: (Raíz Cuadrática Media), luego pedir una biblioteca para calcular esto para ustedes es innecesario sobre-ingeniería. Todas estas métricas son una sola línea de código python en más de 2 pulgadas de largo. Las tres métricas de rmse, mse, rmd, y las empresas son en su núcleo conceptualmente idénticos.

    RMSE responde a la pregunta: «¿Cómo similar, en promedio, son los números en list1 a list2?». Las dos listas deben tener el mismo tamaño. Me quiere «lavar el ruido entre dos elementos dados, lave el tamaño de los datos recogidos, y obtener un solo número de sentir cambios a través del tiempo».

    Intuición y ELI5 para RMSE:

    Imagínese que está aprendiendo a lanzar dardos a un tablero de dardos. Cada día la práctica de una hora. Se quiere averiguar si está mejorando o empeorando. Así que cada día se hacen de 10 tiros y medir la distancia entre la diana y donde el dardo de golpe.

    Que hacer una lista de los números de list1. El uso de la raíz del error cuadrático medio entre las distancias en el día 1 y una list2 que contiene todos los ceros. Hacer lo mismo en el 2 ° y n días. Lo que se obtiene es un número único que es de esperar que disminuye con el tiempo. Cuando el RMSE número es cero, se llega a bullseyes cada vez. Si el rmse número aumenta, están empeorando.

    Ejemplo en el cálculo de la media de la raíz del error cuadrado en python:

    import numpy as np
    d = [0.000, 0.166, 0.333]   #ideal target distances, these can be all zeros.
    p = [0.000, 0.254, 0.998]   #your performance goes here
    
    print("d is: " + str(["%.8f" % elem for elem in d]))
    print("p is: " + str(["%.8f" % elem for elem in p]))
    
    def rmse(predictions, targets):
        return np.sqrt(((predictions - targets) ** 2).mean())
    
    rmse_val = rmse(np.array(d), np.array(p))
    print("rms error is: " + str(rmse_val))

    Que imprime:

    d is: ['0.00000000', '0.16600000', '0.33300000']
    p is: ['0.00000000', '0.25400000', '0.99800000']
    rms error between lists d and p is: 0.387284994115

    La notación matemática:

    Hay una biblioteca de la función de error cuadrático medio (RMSE) en python?

    Glifo Leyenda: n es todo un entero positivo que representa el número de lanzamientos. i representa un todo entero positivo de contador que enumera la suma. d representa el ideal distancias, la list2 que contiene todos los ceros en el ejemplo anterior. p representa el rendimiento, la list1 en el ejemplo anterior. superíndice 2 representa el cuadrado numérico. dyo es la i-esima índice de d. pyo es la i-esima índice de p.

    El rmse realiza en pequeños pasos para que pueda ser entendida:

    def rmse(predictions, targets):
    
        differences = predictions - targets                       #the DIFFERENCEs.
    
        differences_squared = differences ** 2                    #the SQUAREs of ^
    
        mean_of_differences_squared = differences_squared.mean()  #the MEAN of ^
    
        rmse_val = np.sqrt(mean_of_differences_squared)           #ROOT of ^
    
        return rmse_val                                           #get the ^

    Cómo se hace en cada paso de RMSE de trabajo:

    Restar un número de otro le da la distancia entre ellos.

    8 - 5 = 3         #absolute distance between 8 and 5 is +3
    -20 - 10 = -30    #absolute distance between -20 and 10 is +30

    Si se multiplica cualquier número multiplicado por sí mismo, el resultado es siempre positivo porque la negativa veces negativo es positivo:

    3*3     = 9   = positive
    -30*-30 = 900 = positive

    Agregar de todos ellos, pero espera, luego de una matriz con muchos elementos tienen un error mayor que una pequeña matriz, por lo que un promedio de ellos por el número de elementos.

    Pero espera, que al cuadrado de todos ellos anteriores a la fuerza positiva. Deshacer el daño con una raíz cuadrada!

    Que te deja con un único número que representa, en promedio, la distancia entre cada valor de list1 a su correspondiente valor del elemento de la lista2.

    Si el RMSE valor disminuye con el tiempo que estamos felices porque varianza está disminuyendo.

    RMSE no es la más exacta de la línea de la estrategia de ajuste, el total de los mínimos cuadrados es:

    La media de la raíz del error cuadrado mide la distancia vertical entre el punto y la línea, de modo que si sus datos tiene la forma de un plátano, piso cerca de la parte inferior y empinada cerca de la parte superior, a continuación, el RMSE se informe de mayores distancias a puntos altos, pero de corta distancias a puntos bajos, cuando en realidad las distancias son equivalentes. Esto provoca un sesgo en donde la línea se prefiere estar más cerca de los puntos altos que en los bajos.

    Si este es un problema del total método de mínimos cuadrados corrige esto:
    https://mubaris.com/posts/linear-regression

    Trampas que puede romper este RMSE función:

    Si hay valores nulos o infinito en cualquiera de las dos entradas de la lista, luego de la salida de rmse valor se va a no tener sentido. Hay tres estrategias para lidiar con nulos o de falta de valores infinitos en la lista: Ignorar ese componente, cero o agregar una conjetura o un uniforme de ruido aleatorio a todos los timesteps. Cada solución tiene sus pros y sus contras dependiendo de lo que sus medios de los datos. En general, ignorando cualquier componente con un valor que falta es preferido, pero este sesgos del RMSE hacia cero haciendo pensar rendimiento ha mejorado, cuando en realidad no lo sea. La adición de ruido aleatorio en una mejor conjetura podría ser preferible si hay un montón de valores que faltan.

    Con el fin de garantizar la relativa exactitud de los RMSE de salida, debe eliminar todos los valores null/infinitos de la entrada.

    RMSE tiene cero tolerancia para los datos atípicos puntos que no pertenecen

    Root mean squared error plazas se basa en todos los datos a la derecha, y son considerados como iguales. Eso significa una perdida punto que se forma en el campo de la izquierda va a arruinar totalmente la totalidad de cálculo. Para manejar los datos atípicos puntos y despedir a su enorme influencia después de un cierto umbral, ver estimadores Robustos que construir en un umbral para el despido de los valores atípicos.

    • Sí, simple función. Pero si usted lo necesita en el día a día de uso de su agradable de tener sólo una solución correcta disponible en algún lugar, así que usted no tiene que reimplementar es cada vez ; )
    • Te agradecería si pudieras echar un vistazo a esto: stackoverflow.com/questions/45173451/…
    • Es sin duda un signo de esta generación que la gente pide y punto a multi-gigabyte de tamaño de las bibliotecas; se requiere de 3 a 20 minutos de la Red de descarga, a continuación, la CPU de inclinación llena instala, cuando todo lo que realmente necesita es de alrededor de 3 líneas de código que se ajuste en 400 bytes. Si usted pide una biblioteca para un trabajo que puede ser comprimido en 1 línea de código, que es alrededor de 90 caracteres de ancho, entonces estás dando permiso para que las personas abusen de usted con 3, 10, y pronto 50 GB de tamaño instala que son 99,9999% la hinchazón. Esto no es de cohetes de la cirugía. Su accionado solar de la calculadora en el 1978 con 740hz procesador puede hacer RMSE.
  3. 20

    Este es probablemente más rápido?:

    n = len(predictions)
    rmse = np.linalg.norm(predictions - targets) / np.sqrt(n)
  4. 3

    Sólo en caso de que alguien encuentre este hilo en el año 2019, hay una librería llamada ml_metrics que está disponible de forma previa a la instalación en Kaggle del kernels, bastante lightweighted y accesible a través de pypi ( se puede instalar de forma rápida y sencilla con pip install ml_metrics):

    from ml_metrics import rmse
    rmse(actual=[0, 1, 2], predicted=[1, 10, 5])
    # 5.507570547286102

    Tiene unos interesantes de otras métricas que no están disponibles en sklearn, como mapk.

    Referencias:

  5. 2

    De hecho, escribí un montón de esas como las funciones de utilidad para statsmodels

    http://statsmodels.sourceforge.net/devel/tools.html#measure-for-fit-performance-eval-measures

    y
    http://statsmodels.sourceforge.net/devel/generated/statsmodels.tools.eval_measures.rmse.html#statsmodels.tools.eval_measures.rmse

    Mayoría de uno o dos camisas, y no tanto la comprobación de entrada, y destinado principalmente a la facilidad de conseguir algunos de estadísticas al comparar las matrices. Pero ellos tienen pruebas de unidad para el eje argumentos, porque ahí es donde tengo que hacer a veces descuidado errores.

  6. 1

    O simplemente usando sólo NumPy funciones:

    def rmse(y, y_pred):
        return np.sqrt(np.mean(np.square(y - y_pred)))

    Donde:

    • y es mi destino
    • y_pred es mi predicción

    Nota que rmse(y, y_pred)==rmse(y_pred, y) debido a la función cuadrado.

  7. 0

    He aquí un ejemplo de código que calcula el RMSE entre dos polígonos formatos de archivo PLY. Se utiliza tanto en el ml_metrics lib y el np.linalg.norm:

    import sys
    import SimpleITK as sitk
    from pyntcloud import PyntCloud as pc
    import numpy as np
    from ml_metrics import rmse
    
    if len(sys.argv) < 3 or sys.argv[1] == "-h" or sys.argv[1] == "--help":
        print("Usage: compute-rmse.py <input1.ply> <input2.ply>")
        sys.exit(1)
    
    def verify_rmse(a, b):
        n = len(a)
        return np.linalg.norm(np.array(b) - np.array(a)) / np.sqrt(n)
    
    def compare(a, b):
        m = pc.from_file(a).points
        n = pc.from_file(b).points
        m = [ tuple(m.x), tuple(m.y), tuple(m.z) ]; m = m[0]
        n = [ tuple(n.x), tuple(n.y), tuple(n.z) ]; n = n[0]
        v1, v2 = verify_rmse(m, n), rmse(m,n)
        print(v1, v2)
    
    compare(sys.argv[1], sys.argv[2])
  8. 0
    1. No, No es una biblioteca Scikit Aprender para el aprendizaje de máquina y puede ser fácilmente empleado por el uso de lenguaje Python. Tiene la función de Error cuadrático medio que estoy compartiendo el siguiente enlace:

    https://scikit-learn.org/stable/modules/generated/sklearn.metrics.mean_squared_error.html

    1. La función se denomina mean_squared_error como se indica a continuación, donde y_true sería real los valores de la clase para los datos de tuplas y y_pred sería la predicción de valores, predicha por el algoritmo de aprendizaje de máquina que se utilice:

    mean_squared_error(y_true, y_pred)

    1. Tiene que modificar para conseguir RMSE (mediante la función sqrt usando Python).Este proceso se describe en este enlace:
      https://www.codeastar.com/regression-model-rmsd/

    Así, a finales de código sería algo como:

    de sklearn.métricas de importación mean_squared_error
    from math import sqrt

    RMSD = sqrt(mean_squared_error(testing_y, la predicción))

    de impresión(RMSD)

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